Pyhän Marian kirkon rakennustyöt aloitettiin 1343 ja ne saatettiin loppuun 28. heinäkuuta 1502. Kirkon harvinaisuuksiin kuuluu mm. upea Hans Düringerin vuosina 1464-1470 rakentama astronominen kello. Kello näyttää tunnit, päivät, liikkuvat juhlapäivät ja kuun vaiheet. Keskipäivällä kellon ovet avautuvat ja esiin tulevat kolme kuningasta, Apostolit, Aatami ja Eeva ja kuolema.
Kirkko, tai Marian Basilika, jonka rakentaminen kesti yli 150 vuotta, on suurin euroop-palainen tiilirakenteinen uskonnollinen rakennelma. Kirkon goottilainen sisusta erityisen kauniine kristalliholveineen on koristeltu useilla täydellisillä keskiaikaisilla ja barokin mestariteoksilla. Mestariteoksista voidaan mainita mm. augsburgilaisen mestarin Michael Schwarzin valmistama upea pääalttari, kivestä veistetty Pieta noin vuodelta 1410 koskettaa kaikkien tunteita, kopio Hans Memlingin triptyykistä “Viimeinen tuomio” ja kuuluisa astronominen kello. Pelkistetyn ja konstailemattoman kirkon akustiset ominaisuudet tehostavat barokkiurkujen rikasta sointia. Gdanskin kattojen ylle ylväästi kohoavan 82 metrisen kellotornin huipulla on tasanne josta aukeaa upea panoraamanäkymä yli koko kaupungin. Huipulla oleva tasanne antaa kellotornille sen ominaisen silhuetin. Päästäksesi kellotornin huipulle, sinun on kiivettävä melkein 400 porrasta. Käden ulottuvilla kirkosta on barokkityylinen Puolan monarkin, kuningas Jan III Sobieskin perustama Kuninkaallinen kappeli (Kaplica Krolewska), jonka epätavalliseen julkisivuun kuuluu kolme kupolia.
